研究人員根據廣泛的多組學資料創建了一個名為 COmics 的互動式人體分子圖譜。該工具使研究人員能夠探索與糖尿病等疾病相關的分子過程和特徵,為未來的發現提供了巨大的潛力。
卡達威爾康乃爾醫學院 (WCM-Q)的研究人員透過分析從391 名志願者收集的血液、尿液和唾液樣本中的數千個分子,繪製了人體及其複雜生理過程的詳細分子圖譜。
這些數據被整合起來,創建了一個強大的互動式視覺網路工具,稱為Connecting Omics (COmics),可用於研究人類複雜的分子組成並發現與各種疾病相關的潛在特徵。
人體的分子過程是指細胞內和不同細胞之間發生的化學反應和相互作用,包括DNA複製、蛋白質合成、能量產生、細胞通訊和各種代謝途徑等關鍵功能,所有這些都由複雜的蛋白質-蛋白質控制、蛋白質-DNA 和蛋白質-RNA 相互作用,最終實現身體的重要功能。
研究詳情和背景
這項詳盡的研究於 8 月 19 日發表 台灣電話號碼庫 在整理了卡達糖尿病代謝組學研究(QMDiab) 12 年的數據,這是一項針對卡達多民族人群(主要是阿拉伯人、菲律賓人和印度人)的糖尿病病例對照研究。
「我們的想法是將我們十多年來在多組學研究中學到的所有知識結合起來,創建人體及其過程的綜合分子模型,」資深作者、生理學和生物物理學教授、成員Karsten Suhre 博士說。 “想要在分子水平上研究人體如何工作以及形成假設以通過實驗進行測試的研究人員可以免費訪問和使用這個參考工具。”
資料收集與分析
透過與哈馬德醫療公司合作,研究人員從 清楚了解科技在現代商業中的好處 患有或未患有糖尿病的志願者身上收集了多份血液、尿液和唾液樣本。隨後在 18 個不同的高通量分析平台上對樣本進行了表徵,提供了極其豐富的數據集,包括 6,300 個單獨的分子數據點,包括基因組數據 (DNA)、轉錄組 ( RNA )、蛋白質和代謝物,例如胺基酸、糖和脂肪。此外,他們還確定了每位參與者的遺傳變異、DNA 甲基化位點和基因表現的資訊。
這使得研究人員能夠發現遺傳特徵與特定蛋白質、代謝過程和疾病之間的關聯和途徑。然後,他們煞費苦心地將來自所有個人的大量數據整合到一個基於網路的線上工具中,作為「分子人類」(人體的分子描述)的介面。
多組學方法及其重要性
將基因組學、轉錄組學、代謝組學、蛋白質 奢侈的交易 組學和其他形式的所謂「組學」研究相結合的方法被稱為「多元組學」。近年來,這種方法已成為生物醫學研究人員尋求了解人體和疾病如何真正發揮作用的關鍵策略,提供可能有助於開發新藥物療法的見解。
例如,該研究鑑定並描述了 2 型糖尿病亞型的蛋白質和代謝物,揭示了疾病的不同表現方式。
「我們的綜合組學方法概述了不同分子特徵之間的相互關係以及它們與人的表型的關聯——他們的可觀察特徵,例如他們的外表、生化過程和行為,」第一作者、助理教授Anna Halama 博士說。 「COmics 網路工具中整合的資料規模使研究人員能夠存取數十萬條路徑和關聯來探索,為發現和研究提供了巨大的潛力。